《四庫全書》成書后共抄寫了七部，分貯于七座專用藏書閣中。分別為北京皇宮文淵閣、盛京(沈陽)老皇宮文溯閣、北京圓明園文源閣、承德避暑山莊文津閣(這四閣均在北方，史稱北四閣)及南方的揚(yáng)州大觀堂文匯閣、杭州圣因寺文瀾閣、鎮(zhèn)江金山寺文宗閣(史稱南三閣)。這“北四、南三”七座藏書閣，雖然規(guī)模大小和精致程度有所不同，但建筑樣式均以寧波天一閣為模板。藏書閣名稱中的“淵、源、溯、津、匯、瀾”等字，既反映著文化傳承的淵源關(guān)系，也包含著希望以水鎮(zhèn)火的意圖。鎮(zhèn)江文宗閣的“宗”字雖然沒有“三點(diǎn)水”，但出自“百川朝宗歸于海”的典故，也有“水”的寓意。揚(yáng)州文匯閣與鎮(zhèn)江文宗閣及閣內(nèi)貯藏的兩部《四庫全書》，在太平天國期間，于咸豐三年(1853年)毀于戰(zhàn)火。

　　杭州文瀾閣也在1861年毀于戰(zhàn)爭。文瀾閣本《四庫全書》損毀過半，后由杭州藏書家丁氏兄弟組織人力赴北京抄補(bǔ)得以續(xù)全，但因原書只存一半，故有半部之稱。此書現(xiàn)藏浙江省圖書館。現(xiàn)在的杭州文瀾閣是光緒六年(1880年)重建的。

　　故宮中的文淵閣，在午門內(nèi)的文華殿北側(cè)，如今已是書去樓空。文淵閣本《四庫全書》，是七部書中成書最早的一部。此書現(xiàn)存臺北故宮博物院。

　　圓明園文源閣及閣內(nèi)貯藏的文源閣本《四庫全書》于咸豐十年(1860年10月18日)被英法聯(lián)軍火燒圓明園時焚毀。

　　沈陽文溯閣，在沈陽故宮內(nèi)，文溯閣本《四庫全書》，在1966年10月移交甘肅省圖書館保存。

　　承德文津閣，在避暑山莊內(nèi)。袁世凱任民國總統(tǒng)期間，內(nèi)務(wù)部為在故宮前半部開辦古物陳列所，下令將避暑山莊的文物調(diào)運(yùn)北京。

　　1931年6月25日，國立北平圖書館在北海西側(cè)建成，文津閣本《四庫全書》移入圖書館新樓貯藏，圖書館門前的街道也因此命名為文津街，并沿襲至今。1987年，國家圖書館在紫竹院建成，文津街的老北圖更名為國圖分館，所藏文津閣本《四庫全書》也移至國圖新館的文津廳內(nèi)收藏。

　　文津閣本《四庫全書》共計36，304冊，貯書所用的6，750個木制書函和128個木質(zhì)書架，均為乾隆時期的避暑山莊文津閣原物。國家圖書館與商務(wù)印書館不久前合作影印出版的《四庫全書》，就是以文津閣本為原本影印的。

　　至于當(dāng)年紀(jì)曉嵐等人編纂的《四庫全書》底本，原收藏于清代翰林院。翰林院舊址就在今東長安街公安部院內(nèi)。1900年義和團(tuán)進(jìn)攻東交民巷使館區(qū)時，翰林院及《四庫全書》底本一同毀于戰(zhàn)火。(來源：大公網(wǎng))